第三軍醫(yī)大學是全國重點大學，“2110工程”重點建設院校，全國首批博士學位授權單位和全國首批開辦八年制醫(yī)學教育高校。在醫(yī)學、理學、工學、管理學、教育學、軍事學六個學科門類招收碩士研究生，并接收優(yōu)秀應屆本科畢業(yè)生免試推薦攻讀碩士學位。
　　第三軍醫(yī)大學招收碩士研究生分為學術學位和非全日制研究生專業(yè)學位兩類，其中專業(yè)學位碩士招生學科專業(yè)為臨床醫(yī)學碩士、口腔醫(yī)學碩士、藥學碩士、護理碩士、公共衛(wèi)生碩士、應用心理碩士、工程碩士、軍事碩士，非全日制研究生以培養(yǎng)高級臨床醫(yī)師、口腔醫(yī)師、藥師、護師等應用型人才為目標，側重于臨床實際工作能力的培養(yǎng)。其它學科均只招收學術學位。考生最終錄取類型以個人申報、初試成績和復試考核結果綜合衡定。
　　學校下設基礎部、公共衛(wèi)生與軍事預防醫(yī)學院、藥學院、生物醫(yī)學工程學院、醫(yī)學心理系、高原軍事醫(yī)學系、醫(yī)學檢驗系、醫(yī)學影像系、護理系、研究生管理大隊、學員旅、干部輪訓大隊、衛(wèi)勤訓練大隊以及西南醫(yī)院、新橋醫(yī)院、大坪醫(yī)院野戰(zhàn)外科研究所三所綜合性教學醫(yī)院。共開設臨床醫(yī)學（五年制、八年制）、野戰(zhàn)外科學（五年制、八年制）、預防醫(yī)學（五年制、八年制）、高原醫(yī)學、核醫(yī)學、醫(yī)學心理學、醫(yī)學檢驗、藥學、生物醫(yī)學工程、生物技術、醫(yī)學影像學和護理學等12個本科專業(yè)。
　　長期以來，學校秉承“以質量取勝、以特色取勝”的校訓，人才培養(yǎng)質量和綜合辦學水平顯著提升，先后培養(yǎng)7萬多名專業(yè)技術人才，成長出13位院士、47位將軍和127位三級以上專家教授。學校現(xiàn)有教授副教授850余名，中國科學院和中國工程院院士3名，國家杰出青年科學基金獎獲得者、“長江學者”特聘教授等高層次人才100余名。有博士后流動站和博士學位授權學科點71個，國家重點學科、國家重點實驗室和國家工程技術研究中心25個。建成了世界最大的生物激波實驗室、亞洲最大的低壓氧艙群、我國最大的軌道式生物碰撞實驗室，先后獲得了以6項國家科技進步一等獎為標志的1700多項科技成果，在全國百篇優(yōu)秀博士學位論文、國家自然科學基金、國家三大科技獎勵和學術論文等反映綜合辦學水平的主要指標居全國高校前20位，
　　第三軍醫(yī)大學先后參加了抗日戰(zhàn)爭、解放戰(zhàn)爭、抗美援朝戰(zhàn)爭、中印和中越自衛(wèi)反擊戰(zhàn)等衛(wèi)勤保障任務，多次遂行抗擊非典、汶川特大地震和玉樹抗震救災等非戰(zhàn)爭軍事行動中。面對新的形勢和任務，學校將繼續(xù)發(fā)揚光榮的歷史傳統(tǒng)，傳承“求實、創(chuàng)新、勤奮、獻身”的優(yōu)良校風，按照“實施一流發(fā)展戰(zhàn)略、建設世界醫(yī)學名�！钡目傮w辦學思路，擔當起“發(fā)展國防衛(wèi)生事業(yè)、建設創(chuàng)新型國家”雙重使命，完成好“培養(yǎng)卓越聯(lián)勤軍醫(yī)、提升自主創(chuàng)新能力、遂行多樣化衛(wèi)勤保障”三大任務，加速推進人才培養(yǎng)模式、科技創(chuàng)新方式和衛(wèi)勤保障力生成模式四個轉變，努力把學校建設成為“具有鮮明軍隊特色世界一流研究型軍醫(yī)大學”。