上海海關(guān)學(xué)院在職研究生為“服務(wù)國(guó)家特殊需求人才培養(yǎng)項(xiàng)目——學(xué)士學(xué)位授予單位開(kāi)展培養(yǎng)碩士專業(yè)學(xué)位研究生試點(diǎn)工作單位”，試點(diǎn)培養(yǎng)稅務(wù)碩士專業(yè)學(xué)位研究生。設(shè)有海關(guān)管理系、經(jīng)濟(jì)與工商管理系、法律系、外語(yǔ)系、基礎(chǔ)部（思想政治理論部）等五個(gè)教學(xué)系（部）；設(shè)置了海關(guān)管理、物流管理、審計(jì)學(xué)、國(guó)際商務(wù)、稅收學(xué)、法學(xué)、英語(yǔ)等7個(gè)本科專業(yè)和上海海關(guān)學(xué)院非全日制研究生稅務(wù)碩士專業(yè)學(xué)位點(diǎn)，涵蓋管理學(xué)、經(jīng)濟(jì)學(xué)、法學(xué)、文學(xué)等4個(gè)學(xué)科門類。其中，海關(guān)管理專業(yè)為國(guó)家控制布點(diǎn)特設(shè)專業(yè)，法學(xué)、稅收學(xué)專業(yè)分別是教育部第二、三批高等學(xué)校特色專業(yè)建設(shè)點(diǎn)。

　　上海海關(guān)學(xué)院主要任務(wù)是立足海關(guān)、面向社會(huì)，培養(yǎng)符合海關(guān)事業(yè)和經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展需要的應(yīng)用型、復(fù)合型、涉外型的高素質(zhì)海關(guān)管理專業(yè)人才以及服務(wù)口岸物流和國(guó)際商務(wù)的外經(jīng)貿(mào)專業(yè)人才。并積極開(kāi)展海關(guān)理論研究和國(guó)際交流。學(xué)校同時(shí)承擔(dān)海關(guān)系統(tǒng)中、高級(jí)干部繼續(xù)教育、知識(shí)更新和業(yè)務(wù)培訓(xùn)等任務(wù)；并根據(jù)世界海關(guān)組織（WCO）的分工和亞太區(qū)域國(guó)家和地區(qū)的要求，逐步承擔(dān)該區(qū)域海關(guān)人員培訓(xùn)任務(wù)，履行相應(yīng)的國(guó)際義務(wù)。

　　上海海關(guān)學(xué)院學(xué)校現(xiàn)有專任教師151人，其中教授16人，副教授48人，具有高級(jí)專業(yè)技術(shù)職務(wù)教師的比例為42.4%。具有博士學(xué)位教師65人、碩士學(xué)位教師71人，具有研究生學(xué)歷教師的比例為90.1%。師資隊(duì)伍結(jié)構(gòu)合理，教學(xué)科研水平較高。學(xué)校設(shè)有海關(guān)管理研究所和海關(guān)法、海關(guān)風(fēng)險(xiǎn)管理、關(guān)稅、海關(guān)公共關(guān)系、報(bào)關(guān)等研究中心，緊密結(jié)合海關(guān)改革發(fā)展和雙邊、多邊、區(qū)域海關(guān)國(guó)際合作中面臨的熱點(diǎn)、難點(diǎn)問(wèn)題開(kāi)展科學(xué)研究。2009年，學(xué)校獲準(zhǔn)設(shè)立上海市社會(huì)科學(xué)創(chuàng)新研究基地、上海發(fā)展戰(zhàn)略研究所工作室。公開(kāi)出版學(xué)術(shù)期刊《海關(guān)與經(jīng)貿(mào)研究》。