中國醫(yī)學科學院與北京協(xié)和醫(yī)學院實行院校合一的管理體制，中國醫(yī)學科學院為協(xié)和醫(yī)學院提供雄厚的師資和技術力量，北京協(xié)和醫(yī)學院為醫(yī)科院培養(yǎng)高層次的在職研究生人才，相互依托，優(yōu)勢互補，教研相長。中國醫(yī)學科學院是我國唯一的國家級醫(yī)學科學學術中心和綜合性醫(yī)學科學研究機構。北京協(xié)和醫(yī)學院是我國最早設有八年制臨床醫(yī)學非全日制研究生專業(yè)和護理本科教育的重點醫(yī)學院校。

　　中國醫(yī)學科學院在職研究生培養(yǎng)堅持小規(guī)模招生、高層次培養(yǎng)、高質量輸出的辦學宗旨，在長期的辦學實踐中，凝練出“堅持醫(yī)學精英教育、實行高進優(yōu)教嚴出、注重能力素質培養(yǎng)、強調(diào)三高三基三嚴、開放辦學博采眾長、傳揚優(yōu)良文化傳統(tǒng)”的非全日制研究生辦學特色。

　　北京協(xié)和醫(yī)學院是首批具有博士學位和碩士學位授予權的單位，是學位委員會自行審核博士學位授權一級學科點和碩士學位授權一級學科點的委托學位授予單位。非全日制研究生可分別授予醫(yī)學博士、理學博士(哲學博士)、醫(yī)理雙博士、工學博士、醫(yī)學碩士、理學碩士、工學碩士和管理學碩士等學位，每年授予博士學位人數(shù)位居全國醫(yī)學院校首位。多年來為國家培養(yǎng)了大批優(yōu)秀的臨床醫(yī)學家、醫(yī)學科學家、醫(yī)學教育家、護理學家和醫(yī)政管理學家，為我國醫(yī)學教育、醫(yī)學科學研究和醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)的進步和發(fā)展做出了積極的貢獻，在國內(nèi)外享有很高的聲譽。

　　中國醫(yī)學科學院與北京協(xié)和醫(yī)學院科研實力雄厚，醫(yī)學科研包括基礎醫(yī)學、臨床醫(yī)學、預防醫(yī)學、藥物以及與醫(yī)藥學有關的生物、物理、化學等相關學科，覆蓋了醫(yī)學科學各領域。累計發(fā)表SCI論文3877篇，位居全國醫(yī)學院校之首。

　　中國醫(yī)學科學院與北京協(xié)和醫(yī)學院擁有6所直屬醫(yī)院(北京協(xié)和醫(yī)院、阜外心血管病醫(yī)院、腫瘤醫(yī)院、整形外科醫(yī)院、血液病醫(yī)院和皮膚病醫(yī)院)和一所共建醫(yī)院(北京天壇醫(yī)院)，集綜合性醫(yī)院和�？漆t(yī)院于一體，在心血管疾病、惡性腫瘤、血液病、疑難皮膚病、遺傳性疾病、器官再造、自身免疫性疾病、內(nèi)分泌疾病等重大疑難疾病的診治方面達到國內(nèi)領先和國際先進水平，形成了國內(nèi)外聞名的醫(yī)療、教學和科研緊密結合的醫(yī)療服務體系。眾多著名醫(yī)學專家是院校高超醫(yī)療水平的集中體現(xiàn)，他們是國家醫(yī)療保健委員會、國家醫(yī)學考試委員會、國家醫(yī)療事故鑒定專家委員會、中華醫(yī)學會的核心力量，也是我國醫(yī)療新技術、新標準的倡導者和開拓者。

　　在中華民族實現(xiàn)偉大復興的歷史進程中，面對前所未有的戰(zhàn)略發(fā)展機遇，院校確立了將北京協(xié)和醫(yī)學院建設成為國內(nèi)一流、國際知名的以精英教育為特色的研究型醫(yī)學院校，將中國醫(yī)學科學院創(chuàng)建成為中國醫(yī)學科學研究創(chuàng)新體系核心基地和新型國家醫(yī)學科學院的戰(zhàn)略發(fā)展目標。

　　雙一流建設學科：生物學、生物醫(yī)學工程、臨床醫(yī)學、藥學。